BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB006A10LP1|AL425465
(988 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
3x_Contig1773 1841 0.0
3x_Contig1790 1811 0.0
3x_Contig894 1270 0.0
3x_Contig1614 1091 0.0
3x_Contig1164 449 e-126
3x_Contig1124 367 e-101
3x_Contig1213 223 4e-58
>3x_Contig1773
Length = 8694
Score = 1841 bits (923), Expect = 0.0
Identities = 974/992 (98%), Gaps = 4/992 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gatcctggcagactcgaaaaggagcnaactatttatgaatttgagactgtgccagargat 60
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 4624 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 4683
Query: 61 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatgggggctatggctgggtggtggtt 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 4684 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 4743
Query: 121 ttctcatccttcttgttaaacttctgcrcctctggtsggtcgtatggttacggtgtttac 180
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4744 ttctcatccttcttgttaaacttctgcacctctggtgcgtcgtatggttacggtgtttac 4803
Query: 181 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaractggaggtaaactcgactatgctgcc 240
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4804 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaaactggaggtaaactcgactatgctgcc 4863
Query: 241 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4864 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 4923
Query: 301 ataaacacttcaccaaggragctcatttcgcttggratcgtcattcagaatgttgccgcg 360
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4924 ataaacacttcaccaaggaagctcatttcgcttggaatcgtcattcagaatgttgccgcg 4983
Query: 361 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4984 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 5043
Query: 421 tcaataggtacaggcgccatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 480
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5044 tcaataggtacaggcgcaatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 5103
Query: 481 aagaaaagatccctagctctggggattaccgtggccggtac-ggggttggagggatcgtt 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct: 5104 aagaaaagatccctagctctggggattaccgtggccggtacgggggttggaggaatcgtt 5163
Query: 540 ttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagtgggcgttgatttct 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5164 ttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagtgggcgttgatttct 5223
Query: 600 caatgtatcatatgctcagtgctgagtactgtagcggtgcttttgattagaaccagaaga 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5224 caatgtatcatatgctcagtgctgagtactgtagcggtgcttttgattagaaccagaaga 5283
Query: 660 gacgaggttcagaagtattctgatacgcccacaacagcagtggcgctggatatgttcaag 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5284 gacgaggttcagaagtattctgatacgcccacaacagcagtggcgctggatatgttcaag 5343
Query: 720 tacccagtgatatggttattgatcctttgggtgtgtttcaccatgcttggttatgttgtt 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5344 tacccagtgatatggttattgatcctttgggtgtgtttcaccatgcttggttatgttgtt 5403
Query: 780 caggtctattctctgttctcgtttacgatttctctcggctacacttccaaacaagcctcg 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5404 caggtctattctctgttctcgtttacgatttctctcggctacacttccaaacaagcctcg 5463
Query: 840 gcggtgtcctgtgttatatgtgtgggaatcattgttggaagacmtcttgtgggacttgcc 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 5464 gcggtgtcctgtgttatatgtgtgggaatcattgttggaagacctcttgtgggacttgcc 5523
Query: 900 gcmgataagttcggagcggtgacaacagggatgttctgcmatctgattgtagcta-tctg 958
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct: 5524 gccgataagttcggagcggtgacaacagggatgttctgccatctgattgtagctattctg 5583
Query: 959 tgttatgg-atgtggatt-cgtgcagaaatta 988
|||||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 5584 tgttatggaatgtggattccgtgcagaaatta 5615
>3x_Contig1790
Length = 27369
Score = 1811 bits (908), Expect = 0.0
Identities = 973/993 (97%), Gaps = 6/993 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gatcctggcagactcgaaaaggagcnaactatttatgaatttgagactgtgccagargat 60
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 1060 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 1119
Query: 61 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatgggggctatggctgggtggtggtt 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 1120 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 1179
Query: 121 ttctcatccttcttgttaaacttctgcrcctctggtsggtcgtatggttacggtgtttac 180
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1180 ttctcatccttcttgttaaacttctgcacctctggtgcgtcgtatggttacggtgtttac 1239
Query: 181 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaractggaggtaaactcgactatgctgcc 240
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1240 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaaactggaggtaaactcgactatgctgcc 1299
Query: 241 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1300 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 1359
Query: 301 ataaacacttcaccaaggragctcatttcgcttggratcgtcattcagaatgttgccgcg 360
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1360 ataaacacttcaccaaggaagctcatttcgcttggaatcgtcattcagaatgttgccgcg 1419
Query: 361 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1420 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 1479
Query: 421 tcaataggtacaggcgccatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 480
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1480 tcaataggtacaggcgcaatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 1539
Query: 481 aagaaaagatccctagctct-ggggattaccgt-ggccggtacggggttggagggatcgt 538
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 1540 aagaaaagatccctagctctgggggattaccgtgggccggtacggggttggaggaatcg- 1598
Query: 539 tttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagtgggcgttgatttc 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1599 tttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagtgggcgttgatttc 1658
Query: 599 tcaatgtatcatatgctcagtgctgagtactgtagcggtgcttttgattagaaccagaag 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1659 tcaatgtatcatatgctcagtgctgagtactgtagcggtgcttttgattagaaccagaag 1718
Query: 659 agacgaggttcagaagtattctgatacgcccacaacagcagtggcgctggatatgttcaa 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1719 agacgaggttcagaagtattctgatacgcccacaacagcagtggcgctggatatgttcaa 1778
Query: 719 gtacccagtgatatggttattgatcctttgggtgtgtttcaccatgcttggttatgttgt 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1779 gtacccagtgatatggttattgatcctttgggtgtgtttcaccatgcttggttatgttgt 1838
Query: 779 tcaggtctattctctgttctcgtttacgatttctctcggctacacttccaaacaagcctc 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1839 tcaggtctattctctgttctcgtttacgatttctctcggctacacttccaaacaagcctc 1898
Query: 839 ggcggtgtcctgtgttatatgtgtgggaatcattgttggaagacmtcttgtgggacttgc 898
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1899 ggcggtgtcctgtgttatatgtgtgggaatcattgttggaagacctcttgtgggacttgc 1958
Query: 899 cgcmgataagttcggagcggtgacaacagggatgttctgcmatctgattgtagcta-tct 957
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct: 1959 cgccgataagttcggagcggtgacaacagggatgttctgccatctgattgtagctattct 2018
Query: 958 gtgttatgg-atgtggatt-cgtgcagaaatta 988
||||||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 2019 gtgttatggaatgtggattccgtgcagaaatta 2051
>3x_Contig894
Length = 1786
Score = 1270 bits (637), Expect = 0.0
Identities = 667/680 (98%), Gaps = 1/680 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gatcctggcagactcgaaaaggagcnaactatttatgaatttgagactgtgccagargat 60
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 681 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 622
Query: 61 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatgggggctatggctgggtggtggtt 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 621 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 562
Query: 121 ttctcatccttcttgttaaacttctgcrcctctggtsggtcgtatggttacggtgtttac 180
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 561 ttctcatccttcttgttaaacttctgcacctctggtgcgtcatatggttacggtgtttac 502
Query: 181 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaractggaggtaaactcgactatgctgcc 240
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 501 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaaactggaggtaaactcgactatgctgcc 442
Query: 241 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 441 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 382
Query: 301 ataaacacttcaccaaggragctcatttcgcttggratcgtcattcagaatgttgccgcg 360
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 381 ataaacacttcaccaaggaagctcatttcgcttggaatcgtcattcagaatgttgccgcg 322
Query: 361 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 321 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 262
Query: 421 tcaataggtacaggcgccatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 480
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 261 tcaataggtacaggcgcaatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 202
Query: 481 aagaaaagatccctagctctggggattaccgtggccggtac-ggggttggagggatcgtt 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct: 201 aagaaaagatccctagctctggggattaccgtggccggtacgggggttggaggaatcgtt 142
Query: 540 ttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagtgggcgttgatttct 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 141 ttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagtgggcgttgatttct 82
Query: 600 caatgtatcatatgctcagtgctgagtactgtagcggtgcttttgattagaaccagaaga 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 81 caatgtatcatatgctcagtgctgagtactgtagcggtgcttttgattagaaccagaaga 22
Query: 660 gacgaggttcagaagtattc 679
||||||||||||||||||||
Sbjct: 21 gacgaggttcagaagtattc 2
>3x_Contig1614
Length = 4869
Score = 1091 bits (547), Expect = 0.0
Identities = 574/586 (97%), Gaps = 1/586 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gatcctggcagactcgaaaaggagcnaactatttatgaatttgagactgtgccagargat 60
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 4271 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 4330
Query: 61 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatgggggctatggctgggtggtggtt 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 4331 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 4390
Query: 121 ttctcatccttcttgttaaacttctgcrcctctggtsggtcgtatggttacggtgtttac 180
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4391 ttctcatccttcttgttaaacttctgcacctctggtgcgtcgtatggttacggtgtttac 4450
Query: 181 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaractggaggtaaactcgactatgctgcc 240
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4451 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaaactggaggtaaactcgactatgctgcc 4510
Query: 241 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4511 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 4570
Query: 301 ataaacacttcaccaaggragctcatttcgcttggratcgtcattcagaatgttgccgcg 360
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4571 ataaacacttcaccaaggaagctcatttcgcttggaatcgtcattcagaatgttgccgcg 4630
Query: 361 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4631 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 4690
Query: 421 tcaataggtacaggcgccatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 480
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4691 tcaataggtacaggcgcaatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 4750
Query: 481 aagaaaagatccctagctctggggattaccgtggccggtac-ggggttggagggatcgtt 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct: 4751 aagaaaagatccctagctctggggattaccgtggccggtacgggggttggaggaatcgtt 4810
Query: 540 ttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagt 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4811 ttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagt 4856
>3x_Contig1164
Length = 2302
Score = 449 bits (225), Expect = e-126
Identities = 321/356 (90%), Gaps = 1/356 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gatcctggcagactcgaaaaggagcnaactatttatgaatttgagactgtgccagargat 60
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 1937 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 1996
Query: 61 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatgggggctatggctgggtggtggtt 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 1997 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 2056
Query: 121 ttctcatccttcttgttaaacttctgcrcctctggtsggtcgtatggttacggtgtttac 180
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||||||||
Sbjct: 2057 ttctcatccttcttgttaaacttctggagctctggtggttcatatggttagggtgtttag 2116
Query: 181 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaractggaggtaaactcgactatgctgcc 240
|||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||
Sbjct: 2117 ttgtgatattagatggatagtggaaaataggaaactggaggtaaactggagtatggtggg 2176
Query: 241 att-gggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatatt 299
||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct: 2177 attggggggattgaggtttggtgttgggggtgttttttgtgccttgtacaactatatatt 2236
Query: 300 gataaacacttcaccaaggragctcatttcgcttggratcgtcattcagaatgttg 355
|||||| |||||||||||| |||| |||| | |||| || || ||| |||||||||
Sbjct: 2237 gataaagacttcaccaaggaagctgatttgggttggaatggtgattgagaatgttg 2292
>3x_Contig1124
Length = 2635
Score = 367 bits (184), Expect = e-101
Identities = 211/218 (96%), Gaps = 3/218 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 774 gttgttcaggtctattctctgttctcgtttacgatttctctcggctacacttccaaacaa 833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 15 gttgttcaggtctattctctgttctcgtttacgatttctctcggctacacttccaaacaa 74
Query: 834 gcctcggcggtgtcctgtgttatatgtgtgggaatcattgttggaagacmtcttgtggga 893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 75 gcctcggcggtgtcctgtgttatatgtgtgggaatcattgttggaagacctcttgtggga 134
Query: 894 cttgccgcmgataagttcggagcggtgacaacagggatgttctgcmatctgattgtagct 953
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 135 cttgccgccgataagttcggagcggtgacaacagggatgttctgccatctgattgtagct 194
Query: 954 a-tctgtgttatgg-atgtggatt-cgtgcagaaatta 988
| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||
Sbjct: 195 attctgtgttatggaatgtggattccgtgcaaaaatta 232
>3x_Contig1213
Length = 3226
Score = 223 bits (112), Expect = 4e-58
Identities = 136/142 (95%), Gaps = 3/142 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 850 gtgttatatgtgtgggaatcattgttggaagacmtcttgtgggacttgccgcmgataagt 909
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 3226 gtgttatatgtgtgggaatcattgttggaagacctcttgtgggacttgccgccgataagt 3167
Query: 910 tcggagcggtgacaacagggatgttctgcmatctgattgtagcta-tctgtgttatgg-a 967
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct: 3166 tcggagcggtgacaacagggatgttctgccatctgattgtagctattctgtgttatggaa 3107
Query: 968 tgtggatt-cgtgcagaaatta 988
|||||||| |||||||||||||
Sbjct: 3106 tgtggattccgtgcagaaatta 3085
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.38 0.712 1.31
Gapped
Lambda K H
1.38 0.712 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 5342
Number of Sequences: 1807
Number of extensions: 5342
Number of successful extensions: 35
Number of sequences better than 1.0e-20: 7
length of query: 988
length of database: 10,358,551
effective HSP length: 16
effective length of query: 972
effective length of database: 10,329,639
effective search space: 10040409108
effective search space used: 10040409108
T: 0
A: 40
X1: 6 (12.0 bits)
X2: 15 (29.9 bits)
S1: 12 (24.4 bits)
S2: 50 (100.2 bits)